Общие направления фундаментальных исследований по университету, факультетам и кафедрам представлены следующими проблемами: ретроспективное изучение казахской цивилизации как феномена всемирной истории – предмет изучения кафедр истории и философии; мирохозяйственные связи Казахстана и мировая экономика – основное направление деятельности преподавателей факультета экономики; актуальные вопросы государственного права и криминологии изучаются на юридическом факультете; внешняя политика Республики Казахстан – предмет анализа исследователей кафедры истории и международных отношений; психолого-педагогические основы профессиональной подготовки специалистов – комплексная программа факультета педагогики и психологии; математика в информатике и вычислительной технике представлена на факультете информационных систем; сравнительное языкознание, специальная терминология, вопросы развития национальной литературы изучаются преподавателями кафедры казахского языка и литературы, иностранных языков и языковых кафедр факультетов. Фундаментальные исследования публикуются в виде монографий и книг, научных брошюр, сборников и статей. Прикладные направления научных изысканий реализуются учебниками, учебными пособиями и методическими разработками.

Многие научные проекты университета возглавляли и возглавляются известными учеными Казахстана:

—  в области истории и теории цивилизации и отечественной истории – К.Н. Нурпеис, Е.С. Омаров, Б.И. Кумеков, К.М. Байпаков, А.Г. Сармурзин, Т.Х. Тлеуов, В.П. Осипов;

—  в сфере всемирной истории, международных отношений и политологии – Ж.У. Ибрашев, Б. Аяган, К.Р. Несипбаева, К.Ш. Хафизова, А.Ю. Зайниева;

—  в экономике и международных экономических отношениях – В.И. Коваль, М.К. Тусеева, В.Д. Мельников, С. Батыршаулы, Б.Б. Темиргалиев, К.А. Тлеубердина, А.Д. Сапарбаев;

—  в философии – Ж.М. Абдильдин, А.Н. Нысанбаев, А.Г. Касымжанов, Е.С. Бурова, Б.Р. Казыханова;

—  в области права – Е.И. Каиржанов,  З.О. Ашитов, М.Т. Баймаханов;

—  в филологии – О.А. Айтбаев,  Н. Оралбаева, Ш.Ш. Сарыбаев, Б.А. Абылкасимов, К.А. Курманалиев;

—  в педагогике и психологии – С.А. Узакбаева, А.К. Ахметов, С.М. Джакупов, С.К.Калиев,  Х.Т. Шерьязданова, З.Б. Мадалиева, М.А. Перленбетов;

в информатике и математике — С.А. Атанбаев, И.Т. Утепбергенов, К.Б. Тлебаев, К. Мукашев  и многие другие.